phylostems

phylostems est une application développée pour le CIRAD. Elle a pour objectif d’explorer un arbre de données phylogénétiques hétérochrones (dont les branches/échantillons n’ont pas le même âge). Elle permet de détecter la présence de signal temporel (corrélation positive entre la date d’échantillonnage et la distance génétique) à chaque noeud de l’arbre.

Allez la voir à cette adresse : https://pvbmt-apps.cirad.fr/apps/phylostems/ (in english). Son code source est ici.